《长春工程学院学报·自然科学版》杂志在全国影响力巨大，创刊于2000年，公开发行的季刊杂志。创刊以来，办刊质量和水平不断提高，主要栏目设置有：基础研究、工程与技术、计算机及其应用、论述与研究等。《长春工程学院学报·自然科学版》是经吉林省新闻出版局报请国家新闻出版署批准的国内外公开出版发行的高校学术理论刊物。目前学报已被中国期刊全文数据库（光盘版）、《万方数据库——数字化期刊群》、《中文科技期刊数据库》全文收录。
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